Empezó su carrera en las inferiores de Unión, en un determinado momento de su vida sufrió una lesión que le impidió estar activo aproximadamente 6 meses y le costó bastante volver al ruedo. El futbol le dio revancha y su rendimiento dio un giro inesperado.
En 9 de Julio, el delantero empezó a demostrar que los goles eran su prioridad y eso hacía que aporte mucho para el Pulgón. Por otra parte, aterrizó en el Nuevo Fortín de Nueva Roma, la Academia recibió los goles de Núñez y por su buena actuación pasó a jugar al equipo de Horacio Vailatti.
En Atlético Pujato llevaba convertidos 11 goles, era goleador del equipo y funcionaba muy bien en el esquema del Pincha. De golpe y porrazo, el conjunto que es tres veces consecutivas campeón de la Liga se queda sin su referente de área. Joel Núñez acordó todo con el Aqaba de Jordania, equipo que milita en la primera división de aquel país.
El joven futbolista, viaja para cumplir el sueño de ser profesional y de adquirir nuevos conocimientos en su carrera.